156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0089 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
184 aa  360  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  94.57 
 
 
184 aa  324  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  80.75 
 
 
185 aa  295  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  76.11 
 
 
185 aa  272  2e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  72.96 
 
 
189 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  66.29 
 
 
186 aa  217  8e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  71.97 
 
 
187 aa  211  6e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  63.54 
 
 
183 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  65.29 
 
 
184 aa  208  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  64.97 
 
 
184 aa  206  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  67.7 
 
 
202 aa  203  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  60.77 
 
 
183 aa  197  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  66.03 
 
 
194 aa  196  1e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  66.03 
 
 
194 aa  196  1e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  64.74 
 
 
193 aa  192  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  62.73 
 
 
184 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  61.63 
 
 
184 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  66.45 
 
 
191 aa  188  3e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  61.64 
 
 
190 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  61.64 
 
 
190 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  64.46 
 
 
184 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  62.82 
 
 
185 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  65.41 
 
 
195 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  54.89 
 
 
189 aa  185  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  56.28 
 
 
186 aa  183  1e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  64.1 
 
 
193 aa  181  4e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  61.35 
 
 
194 aa  181  4e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  56.25 
 
 
184 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  61.49 
 
 
183 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  62.18 
 
 
191 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  56.33 
 
 
187 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  54.29 
 
 
210 aa  140  1e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  47.43 
 
 
161 aa  135  3e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  48.26 
 
 
165 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  46.78 
 
 
162 aa  130  8e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  51.61 
 
 
166 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  51.72 
 
 
187 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  51.72 
 
 
187 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  4.78309e-07 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  46.41 
 
 
163 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 
134 aa  120  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  47.37 
 
 
156 aa  119  2e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  39.35 
 
 
179 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
202 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  48.68 
 
 
187 aa  117  1e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  43.72 
 
 
166 aa  116  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  46.05 
 
 
156 aa  116  2e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  46 
 
 
160 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  46.98 
 
 
164 aa  115  4e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  44.97 
 
 
167 aa  112  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  44.38 
 
 
160 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  48.99 
 
 
208 aa  112  4e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  40.64 
 
 
178 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.28 
 
 
141 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  41.99 
 
 
169 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.37 
 
 
220 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  39.73 
 
 
192 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  46.62 
 
 
157 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.22 
 
 
186 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.32 
 
 
194 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  38.75 
 
 
194 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
279 aa  104  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  34.64 
 
 
354 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
261 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  39.46 
 
 
238 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  44.3 
 
 
190 aa  99  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  46.21 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  46.26 
 
 
168 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  42.47 
 
 
150 aa  92.8  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.95 
 
 
308 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 
133 aa  91.7  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  40.69 
 
 
133 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.41 
 
 
133 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  37.42 
 
 
272 aa  88.2  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  45.33 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.69 
 
 
558 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  38.19 
 
 
151 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.78 
 
 
139 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  9.21903e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  39.46 
 
 
142 aa  84.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  38.36 
 
 
133 aa  83.6  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  38.36 
 
 
133 aa  83.6  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 
160 aa  81.6  6e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  37.08 
 
 
161 aa  80.9  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  39.71 
 
 
143 aa  80.1  1e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  35.4 
 
 
194 aa  78.6  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
160 aa  77.8  8e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  37.36 
 
 
212 aa  76.6  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  32.43 
 
 
134 aa  75.5  4e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
133 aa  75.1  6e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 
330 aa  74.3  8e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  37.75 
 
 
611 aa  74.3  8e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 
222 aa  73.2  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 
163 aa  72.8  2e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0450  beta-Ig-H3/fasciclin  35.14 
 
 
184 aa  72.8  3e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  72.8  3e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 
163 aa  72.8  3e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  32.41 
 
 
134 aa  71.6  6e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  35.81 
 
 
194 aa  71.2  8e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  37.18 
 
 
200 aa  70.9  9e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  27.89 
 
 
139 aa  70.1  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  28 
 
 
135 aa  70.1  2e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>