203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3198 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 329 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  92.4 
 
 		 328 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  53.89 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  54.55 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  41.96 
 
 		 334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  39.33 
 
 		 505 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  36.05 
 
 		 488 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  36.05 
 
 		 488 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  36.7 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  35.03 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  31.68 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  31.9 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  30.28 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  30.91 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  29.7 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  32.28 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  32.28 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  31.37 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  32.15 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  32.87 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  43.09 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  40.65 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  37.75 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  41.32 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  26.4 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  32.2 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  32.28 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  32.85 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  26.28 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  34.58 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  30.63 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.92 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  29.73 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  36.21 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  33.33 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  34.71 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  34.78 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  34.53 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  33.82 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  31.53 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  30.63 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  33.06 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  29.23 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  33.64 
 
 		 272 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  33.65 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  29.73 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.73 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  34.92 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  29.73 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  30.17 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.04 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  32.11 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  33.65 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  29.31 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.85 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  29.73 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  28.17 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  29.46 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  30.84 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  34.23 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  30.84 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  34.23 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.51 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  32.53 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>