More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2659 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  85.23 
 
 		 149 aa  261  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  79.19 
 
 		 149 aa  245  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  79.19 
 
 		 149 aa  245  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  79.19 
 
 		 149 aa  245  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  76.51 
 
 		 149 aa  245  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  77.18 
 
 		 149 aa  240  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  75.68 
 
 		 151 aa  234  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  71.43 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  67.12 
 
 		 155 aa  214  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  67.35 
 
 		 154 aa  213  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  67.35 
 
 		 147 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 149 aa  209  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 170 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 164 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  61.07 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  61.07 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  52.41 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  53.9 
 
 		 172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  51.72 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  53.57 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  53.57 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  51.03 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  52.82 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  53.57 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  51.03 
 
 		 170 aa  156  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  52.11 
 
 		 155 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  52.11 
 
 		 156 aa  156  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  47.65 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  53.57 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  52.82 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  52.82 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 175 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 154 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 156 aa  151  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2166  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.13572  normal  0.0195727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 174 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  50 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>