More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5518 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5518  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593502  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4611  transcriptional regulator, LysR family  69.82 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.144049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4477  transcriptional regulator, LysR family  69.82 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861356  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5011  LysR family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.967403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5138  LysR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 289 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5370  LysR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 287 aa  344  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.626785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5191  LysR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 289 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0327  LysR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1279  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 293 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4604  transcriptional regulator, LysR family  56.84 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4470  transcriptional regulator, LysR family  56.84 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0844089  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4288  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.423442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6501  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711222  normal  0.162689 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3146  LysR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2533  LysR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4191  LysR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7527  LysR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3166  LysR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3084  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115544  normal  0.0198492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3199  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2407  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2552  LysR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3254  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819694  normal  0.147179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44180  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3758  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2547  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291089  decreased coverage  0.00703073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3168  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.655223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3369  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3681  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1421  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2218  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.573789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2677  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3260  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.670628  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47310  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1695  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.909005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4082  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2996  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.563844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0485  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2144  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1835  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3460  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143807  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2210  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3528  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  32.35 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2115  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  32.48 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3682  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.903074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2143  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1620  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2254  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0160178  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  29.23 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0425  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5152  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.18 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2414  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  32.49 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3919  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>