More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5282 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  49.23 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  45.79 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  34.62 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  35.36 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  31.39 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  33.67 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.51 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  33.67 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  33.67 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  32.82 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.07 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.37 
 
 		 380 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  34.33 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  32.47 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  33.59 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  31.63 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.01 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  31.94 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.95 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.79 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.71 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.05 
 
 		 387 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.08 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.1 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.88 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.66 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.98 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.71 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  33.13 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.44 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  32.24 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.05 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.85 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.1 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.15 
 
 		 385 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  31.3 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  30.87 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.88 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  32.28 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  32.89 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.77 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  32.45 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.19 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.78 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  31.07 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.79 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  33.33 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  29.92 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  32.63 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.92 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  29.92 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  31.22 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.37 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  33.33 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  32.31 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  31.22 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  31.4 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.81 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.57 
 
 		 383 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  29.44 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  31.69 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.03 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  30.88 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.1 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.88 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  30.2 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  30.59 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  32.39 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  30.4 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  29.07 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  30.43 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  28.72 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.67 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  28.5 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  30.16 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  30.37 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  30.92 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  29.63 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  31.46 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  29.33 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  30.29 
 
 		 395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.23 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.23 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.23 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.97 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  30.61 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.97 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.61 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.97 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.02 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.97 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.43 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.45 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.87 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.45 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>