41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0008 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  100 
 
 		 249 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  51.96 
 
 		 109 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  45.97 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  45.97 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  27.42 
 
 		 371 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  44.09 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  50 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  38.46 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  46.48 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  41.94 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  35.59 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  36.21 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  32.1 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  39.5 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  40.74 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  46.43 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  46.55 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  40.3 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  31.9 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  28.32 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  27.04 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  29.25 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  30.53 
 
 		 426 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  30.61 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  25.86 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  32.73 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  29.17 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  26.29 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  30.28 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>