More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3878 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  52.04 
 
 		 1150 aa  1138    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  77.14 
 
 		 1196 aa  1889    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  33.31 
 
 		 1187 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.73 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  41.52 
 
 		 1157 aa  863    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  39.85 
 
 		 1181 aa  802    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  39.53 
 
 		 1183 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.71 
 
 		 1132 aa  732    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.87 
 
 		 1133 aa  736    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.87 
 
 		 1133 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  41.61 
 
 		 1223 aa  877    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.79 
 
 		 1132 aa  733    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  42.62 
 
 		 1158 aa  897    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  37.68 
 
 		 1182 aa  789    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  40.8 
 
 		 1171 aa  815    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  41.38 
 
 		 1178 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  41.67 
 
 		 1184 aa  847    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  39.64 
 
 		 1178 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  37.7 
 
 		 1169 aa  752    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  41.29 
 
 		 1215 aa  862    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.71 
 
 		 1132 aa  740    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  42.7 
 
 		 1154 aa  906    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  41.49 
 
 		 1169 aa  861    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.54 
 
 		 1208 aa  794    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  39.47 
 
 		 1208 aa  815    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  42.39 
 
 		 1151 aa  845    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  38.16 
 
 		 1191 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.71 
 
 		 1132 aa  732    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  35.84 
 
 		 1163 aa  726    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  34.38 
 
 		 1188 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  40.41 
 
 		 1190 aa  825    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  38.54 
 
 		 1182 aa  765    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  39.62 
 
 		 1214 aa  767    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.62 
 
 		 1132 aa  741    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  52.13 
 
 		 1150 aa  1157    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  51.66 
 
 		 1189 aa  1186    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  41.84 
 
 		 1167 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  37.6 
 
 		 1182 aa  787    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  34.22 
 
 		 1188 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  41.58 
 
 		 1193 aa  805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  41.71 
 
 		 1173 aa  860    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.95 
 
 		 1132 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  37.48 
 
 		 1214 aa  762    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  52.38 
 
 		 1149 aa  1130    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.95 
 
 		 1132 aa  742    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  41.91 
 
 		 1154 aa  895    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  34.17 
 
 		 1188 aa  741    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  39.84 
 
 		 1195 aa  787    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  39.14 
 
 		 1212 aa  831    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  100 
 
 		 1208 aa  2467    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  35.76 
 
 		 1191 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  93.06 
 
 		 1254 aa  2281    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  37.99 
 
 		 1197 aa  788    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  39.04 
 
 		 1224 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  36.63 
 
 		 1156 aa  734    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  41.56 
 
 		 1176 aa  847    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  40.31 
 
 		 1192 aa  845    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  42.01 
 
 		 1171 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  40.65 
 
 		 1168 aa  832    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  39.17 
 
 		 1216 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  40.08 
 
 		 1199 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  65.81 
 
 		 1180 aa  1612    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  38.8 
 
 		 1176 aa  810    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  42.28 
 
 		 1158 aa  875    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.85 
 
 		 1132 aa  739    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  41.53 
 
 		 1156 aa  842    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  39.6 
 
 		 1136 aa  788    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  38 
 
 		 1191 aa  817    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.56 
 
 		 1136 aa  784    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  52.04 
 
 		 1150 aa  1139    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  45.64 
 
 		 832 aa  728    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  34.52 
 
 		 1266 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  35.36 
 
 		 1236 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  32.97 
 
 		 1261 aa  592  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  33.73 
 
 		 1245 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  33.57 
 
 		 1246 aa  591  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  32.2 
 
 		 1274 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  33.31 
 
 		 1250 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  32.62 
 
 		 1227 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.47 
 
 		 1226 aa  585  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  32.37 
 
 		 1228 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  33.12 
 
 		 1267 aa  582  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.53 
 
 		 1226 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  32.96 
 
 		 1245 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  33.04 
 
 		 1241 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  32.16 
 
 		 1261 aa  579  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  32.62 
 
 		 1238 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  32.33 
 
 		 1233 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  32.96 
 
 		 1232 aa  576  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  32.29 
 
 		 1226 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  32.07 
 
 		 1244 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  32.45 
 
 		 1226 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1272 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  33.1 
 
 		 1245 aa  576  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  32.41 
 
 		 1244 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  32.25 
 
 		 1244 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  31.99 
 
 		 1263 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  32.62 
 
 		 1228 aa  572  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  33.01 
 
 		 1278 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  32.13 
 
 		 1227 aa  572  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>