More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3832 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  84.5 
 
 		 530 aa  915    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  100 
 
 		 556 aa  1114    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  60.49 
 
 		 532 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  48.07 
 
 		 543 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  41.21 
 
 		 527 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  42.09 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  42.72 
 
 		 522 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  35.33 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.98 
 
 		 560 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  35.26 
 
 		 550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.91 
 
 		 565 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  37.29 
 
 		 579 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  35.41 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  35.05 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  39.26 
 
 		 568 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 619 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  33.67 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  34.97 
 
 		 583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  33.21 
 
 		 522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  33.09 
 
 		 557 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  39.55 
 
 		 536 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  33.21 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  32.96 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  34.35 
 
 		 552 aa  280  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  32.83 
 
 		 522 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  33.08 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  32.58 
 
 		 522 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  32.58 
 
 		 522 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.58 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  31.58 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.51 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  32.14 
 
 		 520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  32.15 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  39.71 
 
 		 565 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.69 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  40.11 
 
 		 536 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  38.11 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  34.57 
 
 		 563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  40.11 
 
 		 532 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  35.47 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  30.83 
 
 		 544 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  36.91 
 
 		 554 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  34.79 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  38.12 
 
 		 501 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  36.55 
 
 		 549 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.73 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.79 
 
 		 546 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 549 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  35.41 
 
 		 537 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.39 
 
 		 542 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 569 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  33.69 
 
 		 573 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.41 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  32.71 
 
 		 543 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  32.05 
 
 		 564 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.34 
 
 		 543 aa  226  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.52 
 
 		 537 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.93 
 
 		 574 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 573 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  31.47 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  34.07 
 
 		 538 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.54 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 		 540 aa  216  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.3 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.62 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  32.15 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  33.27 
 
 		 539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 544 aa  213  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  36.5 
 
 		 532 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  32.34 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 601 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.51 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  30.05 
 
 		 583 aa  209  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.44 
 
 		 585 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  30.05 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 527 aa  208  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.35 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 564 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  34.13 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.49 
 
 		 543 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 539 aa  203  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  29.36 
 
 		 576 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 538 aa  203  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 589 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  31.89 
 
 		 565 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.84 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.43 
 
 		 580 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  32.12 
 
 		 552 aa  200  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.7 
 
 		 541 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>