More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2437 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 367 aa  726    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  81.64 
 
 		 361 aa  552  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  49.86 
 
 		 349 aa  322  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 348 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.73 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 340 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.83 
 
 		 348 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  47.34 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  48.65 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  47.06 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.84 
 
 		 358 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.98 
 
 		 363 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.98 
 
 		 363 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 		 360 aa  292  8e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.54 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.18 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 363 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.28 
 
 		 357 aa  288  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.46 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.77 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.58 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.63 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 339 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.19 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.06 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.32 
 
 		 377 aa  279  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 337 aa  278  9e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.08 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 356 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  44.19 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  42.94 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 		 336 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.83 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.86 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.6 
 
 		 336 aa  276  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.86 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.23 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.37 
 
 		 348 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.97 
 
 		 340 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 358 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.18 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.2 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  46.07 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.52 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  41.4 
 
 		 377 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  46 
 
 		 354 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.54 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 		 342 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.94 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.4 
 
 		 378 aa  265  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 345 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 353 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  48.84 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  44.51 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.2 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  44.64 
 
 		 346 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.5 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>