More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1902 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  100 
 
 		 478 aa  945    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  94.56 
 
 		 478 aa  876    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  69.26 
 
 		 471 aa  595  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  55.36 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  54.21 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  56.46 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  50.95 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  49.21 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  52.71 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  49.21 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  48.68 
 
 		 518 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  51.99 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  50.11 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  51.44 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  47.26 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  50.11 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  49.55 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  47.32 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  47.91 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  53.22 
 
 		 483 aa  362  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  51.9 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  50.6 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  51.78 
 
 		 449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  44.7 
 
 		 445 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  47.57 
 
 		 509 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  47.73 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  44.81 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  48.05 
 
 		 486 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  48.05 
 
 		 486 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  48.14 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  49.53 
 
 		 486 aa  339  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  46.58 
 
 		 507 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  47.39 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  46.36 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  47.73 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  45.68 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  46.36 
 
 		 507 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  45.43 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  47.92 
 
 		 442 aa  328  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  47.25 
 
 		 478 aa  328  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  47.62 
 
 		 476 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  43.61 
 
 		 514 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  49.04 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  46.48 
 
 		 482 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  39.96 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  47.38 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  48.1 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  44.72 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  47.84 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  43.76 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  43.76 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.84 
 
 		 717 aa  316  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.69 
 
 		 1016 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  49.41 
 
 		 487 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  42.32 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  44.62 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  42.71 
 
 		 541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  42.07 
 
 		 1209 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  44.2 
 
 		 462 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  41.2 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.03 
 
 		 1262 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  43.17 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.73 
 
 		 1018 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  42.83 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  40.48 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  43.91 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  41.56 
 
 		 449 aa  299  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  44.5 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  42.69 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  42.24 
 
 		 437 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  42.06 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_1862  predicted protein  40.92 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  41.67 
 
 		 1322 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  43.62 
 
 		 447 aa  289  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  43.97 
 
 		 416 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  41.71 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  41.23 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  41.23 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  40.94 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  40.94 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  40.94 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  39.17 
 
 		 414 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  40.69 
 
 		 525 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  40.94 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  43.94 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  40.52 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.31 
 
 		 1264 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  41.99 
 
 		 611 aa  280  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  39.13 
 
 		 644 aa  279  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  40.14 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  41 
 
 		 416 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  41.63 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  40.28 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6567  ammonium transporter  39.28 
 
 		 474 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  41.84 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  41.36 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  40.87 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27877  predicted protein  45.7 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  40.58 
 
 		 426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  41.19 
 
 		 471 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>