61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3707 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  100 
 
 		 176 aa  355  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  50.9 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  51.79 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  50.3 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  48.35 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  49.02 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  45.5 
 
 		 189 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  39.77 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  36.42 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  34.36 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  37.13 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.59 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  35.19 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  32 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  29.33 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  31.4 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  32.42 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  29.79 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  25.97 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  25 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  33.68 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  27.93 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  42.37 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  42.37 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  42.37 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  34.74 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  33.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  34.74 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  32.77 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.11 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  28.49 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  30.43 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  30.61 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  39.29 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  32.73 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.43 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  47.92 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  28.27 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  29.69 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  29.87 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  44.64 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  42.86 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  41.67 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  29.93 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  30.53 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.26 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  40.68 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  35.59 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  40.68 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  40.68 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  40.68 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  40.68 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  40.68 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  35.09 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  42.55 
 
 		 140 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  40.74 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  30.99 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  42.55 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  40.82 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>