More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2337 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  91.88 
 
 		 320 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  72.2 
 
 		 313 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  64.54 
 
 		 313 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  66.88 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  64.86 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  64.47 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  63.58 
 
 		 318 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  63.37 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  63.58 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  58.39 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  56.31 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  56.31 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  55.8 
 
 		 321 aa  358  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  48.97 
 
 		 302 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  48.85 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  48.52 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  49.84 
 
 		 303 aa  285  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  48.2 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  48.2 
 
 		 305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  49.18 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  49.02 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  47.37 
 
 		 304 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  49.67 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  48.52 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  48.01 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  42.18 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  46.25 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  45.86 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  45.69 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  50.34 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  44.95 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  45.6 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  45.28 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  49.31 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  44.98 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  38.51 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  46.43 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  37.46 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  31.98 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  32.08 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.92 
 
 		 560 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  30.88 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  32.98 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  33.96 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  32.84 
 
 		 380 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  33.57 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  33.45 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  31.95 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  31.95 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  28.98 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  31.1 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  30.45 
 
 		 363 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  31.58 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  31.03 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  31.58 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  32.88 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  31.7 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  31.58 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  32.88 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  29.73 
 
 		 479 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  37.79 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  29.94 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  29.32 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  29.32 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  29.32 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  29.32 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.32 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  29.32 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  29.32 
 
 		 391 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  29.32 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  29.32 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  29.56 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  32.42 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  41.78 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  29.7 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  38.34 
 
 		 400 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.77 
 
 		 713 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.77 
 
 		 713 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.77 
 
 		 713 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.47 
 
 		 711 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  27.84 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.02 
 
 		 807 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.64 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  26.49 
 
 		 395 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.47 
 
 		 711 aa  99.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  29.21 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  34.39 
 
 		 400 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  35.56 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  30.83 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  27.84 
 
 		 397 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  31.44 
 
 		 409 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  37.33 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  27.35 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.88 
 
 		 712 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  31.67 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30 
 
 		 711 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>