More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1619 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1467  heavy metal efflux P-type ATPase  65.97 
 
 
950 aa  1245    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.897361  hitchhiker  0.000055818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1619  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
965 aa  1992    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.265996  unclonable  0.00000000106661 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1645  heavy metal translocating P-type ATPase  65.93 
 
 
964 aa  1246    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.029405  hitchhiker  0.00127131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 
807 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
815 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
802 aa  466  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 
819 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
812 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  29.39 
 
 
806 aa  347  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  29.83 
 
 
806 aa  347  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
834 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
846 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.1 
 
 
799 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 
813 aa  318  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  37.07 
 
 
803 aa  318  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
811 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.7 
 
 
790 aa  317  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  27.75 
 
 
808 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
799 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  37.45 
 
 
803 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.57 
 
 
794 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  37.07 
 
 
803 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  39.11 
 
 
794 aa  314  5.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
816 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
838 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  38.74 
 
 
811 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  38.85 
 
 
839 aa  310  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  36.73 
 
 
799 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 
799 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
799 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  29.2 
 
 
727 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  35.65 
 
 
791 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
787 aa  307  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
823 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
824 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  25.93 
 
 
793 aa  305  3.0000000000000004e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
882 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
824 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
800 aa  304  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
824 aa  301  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
826 aa  301  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.42 
 
 
795 aa  300  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  36.22 
 
 
787 aa  299  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  34.45 
 
 
797 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 
799 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  36.77 
 
 
806 aa  292  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  37.01 
 
 
765 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
799 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  35.74 
 
 
847 aa  288  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
802 aa  287  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
814 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  36.09 
 
 
851 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
820 aa  284  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
847 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  27.84 
 
 
792 aa  283  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 
792 aa  276  9e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  28.54 
 
 
817 aa  275  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
792 aa  272  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
791 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  29.15 
 
 
807 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
805 aa  270  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  37.18 
 
 
792 aa  270  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
813 aa  269  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  26.88 
 
 
818 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  32.76 
 
 
796 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  35.17 
 
 
811 aa  265  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 
810 aa  262  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  32.7 
 
 
792 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 
799 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
799 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  26.65 
 
 
805 aa  261  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 
849 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  28.35 
 
 
799 aa  261  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
790 aa  259  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  33.65 
 
 
792 aa  259  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  34.22 
 
 
1087 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  26.17 
 
 
861 aa  258  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  32.06 
 
 
792 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
800 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  26.83 
 
 
806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.77 
 
 
894 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  34.63 
 
 
814 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  26.42 
 
 
735 aa  255  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
817 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  33.21 
 
 
826 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.65 
 
 
818 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  34.56 
 
 
724 aa  254  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  35 
 
 
905 aa  254  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
861 aa  254  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 
804 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
889 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
808 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.07 
 
 
797 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 
889 aa  252  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 
817 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.52 
 
 
797 aa  251  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 
817 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  25.44 
 
 
721 aa  251  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.91 
 
 
798 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  27.02 
 
 
803 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>