More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0042 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  82.94 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  81.76 
 
 		 184 aa  288  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  67.28 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  66.67 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  67.9 
 
 		 168 aa  225  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  64.71 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  63.53 
 
 		 168 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  61.76 
 
 		 168 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  61.18 
 
 		 168 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  60.59 
 
 		 168 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  60.59 
 
 		 168 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  59.76 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  60.36 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  59.88 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  59.88 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  58.28 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  58.28 
 
 		 171 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  58.08 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  57.56 
 
 		 170 aa  201  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  59.26 
 
 		 169 aa  200  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  63.19 
 
 		 167 aa  200  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  56.8 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  58.02 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  59.88 
 
 		 216 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  59.88 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  59.88 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  59.88 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  59.88 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  59.88 
 
 		 167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  59.88 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  59.88 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  58.08 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  57.41 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  54.97 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  55.88 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  56.17 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  57.41 
 
 		 167 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  52.73 
 
 		 171 aa  190  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  55.03 
 
 		 170 aa  190  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  55.03 
 
 		 170 aa  190  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  55.56 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  55.29 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  55.56 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  55.56 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  51.52 
 
 		 171 aa  187  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  55.56 
 
 		 169 aa  187  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  55.29 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  56.17 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  53.85 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  54.65 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  56.79 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  54.32 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  56.36 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  56.36 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  54.94 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  54.12 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  56.36 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  51.76 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  56.79 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  56.36 
 
 		 168 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  56.79 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  56.79 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  56.79 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  53.01 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  56.79 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  56.21 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  56.79 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  56.79 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  56.79 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  56.21 
 
 		 169 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  57.42 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  54.44 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  50.88 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  51.76 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  56.79 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  53.09 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  56.79 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  56.79 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  56.79 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  56.32 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  50 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  55.62 
 
 		 169 aa  175  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  54.76 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  51.72 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  50.59 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  52.66 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>