More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3922 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 308 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  55.23 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.79 
 
 		 337 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.21 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  30.56 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.63 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  32.5 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  36.64 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 1171 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  27.08 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 350 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  27.92 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  46 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  43.52 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  31.28 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.94 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  27.88 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  31.67 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.29 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.71 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.71 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.25 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  33.94 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  27.61 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.04 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  34 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  36.45 
 
 		 102 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  26.36 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 597 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1715  protein CgeD  30.53 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.81 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>