124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3233 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  100 
 
 		 171 aa  356  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  83.63 
 
 		 171 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  82.46 
 
 		 171 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  82.46 
 
 		 171 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.06 
 
 		 172 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.47 
 
 		 172 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.47 
 
 		 172 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.06 
 
 		 172 aa  286  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.06 
 
 		 172 aa  286  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.06 
 
 		 172 aa  286  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.06 
 
 		 172 aa  286  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  77.06 
 
 		 172 aa  286  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.47 
 
 		 172 aa  286  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  74.12 
 
 		 172 aa  286  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  76.47 
 
 		 172 aa  286  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  75.88 
 
 		 172 aa  285  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  75.88 
 
 		 172 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  72.94 
 
 		 172 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  72.94 
 
 		 172 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  72.94 
 
 		 172 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  74.12 
 
 		 172 aa  280  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  70.59 
 
 		 172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  70.59 
 
 		 172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  70.59 
 
 		 172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  70 
 
 		 172 aa  271  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  71.18 
 
 		 172 aa  270  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  69.41 
 
 		 172 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  69.41 
 
 		 172 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  70 
 
 		 172 aa  263  8e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  69.41 
 
 		 172 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  70.18 
 
 		 171 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  64.71 
 
 		 172 aa  244  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  64.71 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  64.71 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  64.29 
 
 		 173 aa  236  8e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  58.48 
 
 		 172 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  58.48 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  58.48 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  58.48 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  58.48 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  57.06 
 
 		 171 aa  217  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  57.89 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  57.06 
 
 		 171 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  56.73 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  52.66 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  52.07 
 
 		 172 aa  197  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  50.89 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  51.48 
 
 		 172 aa  194  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  49.69 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  68.87 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  38.46 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  36.69 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  39.39 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  37.28 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  37.95 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.34 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  30.72 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  30.12 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  32.37 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.33 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  29.94 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.97 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  31.47 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  31.47 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.47 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.47 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.76 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  31.76 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.35 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.72 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  28.31 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  30.34 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  30.34 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.13 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.18 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  31.95 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.55 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.55 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  30.34 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.73 
 
 		 182 aa  87.8  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.93 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  30.72 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.72 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.55 
 
 		 159 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  29.68 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.36 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.74 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.74 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  27.43 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  28.65 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.31 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  28.79 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  29.63 
 
 		 593 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>