68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1101 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  28.95 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  27.83 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  26.17 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  29.82 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  35.59 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  30.3 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  32.52 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  26.6 
 
 		 119 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  25.53 
 
 		 119 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  25.53 
 
 		 119 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  28.85 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  29.17 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  28.85 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  28.85 
 
 		 172 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  32.91 
 
 		 138 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  27.1 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  28.18 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  27.97 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  31.43 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  31.43 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  28.83 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  26.45 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  23.39 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  28.72 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  23.39 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  23.39 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  30.11 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  27.45 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  24.24 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  24.24 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  24.24 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  24.24 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  23.02 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  29.03 
 
 		 139 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  29 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  25.45 
 
 		 119 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  29 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  24.76 
 
 		 141 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  31.4 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  25.22 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  23.68 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  30.93 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  31.9 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  29.91 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4992  hypothetical protein  26.02 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536213  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  26.23 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 		 106 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.52 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  23.96 
 
 		 120 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  24.55 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  28.71 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.84 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  28.45 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  34 
 
 		 141 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  26.6 
 
 		 158 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  27 
 
 		 134 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  31.03 
 
 		 139 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.23 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>