More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1083 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  691    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  55.15 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  51.44 
 
 		 325 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  50.34 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3770  hypothetical protein  42.71 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2406  hypothetical protein  48.82 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4273  hypothetical protein  42.37 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.43 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.57 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  42.47 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.99 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.9 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.42 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  43.91 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.31 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.14 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.72 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.6 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.04 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.67 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.21 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.25 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.44 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.28 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.62 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.58 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.94 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.94 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.27 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42 
 
 		 327 aa  259  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  45.05 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.95 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.48 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.46 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.28 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.94 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.27 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.3 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.46 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.59 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.62 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.68 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  41.86 
 
 		 332 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.56 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.81 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.65 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.49 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.67 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.66 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.82 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.35 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  42.72 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.41 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.41 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.68 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.69 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  42.61 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.63 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.48 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  37.87 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.72 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  39.68 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.12 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.88 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.74 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.28 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.82 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  39.02 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  39.6 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  39.87 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.43 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.33 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  40.94 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.11 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.62 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.07 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  38.92 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.28 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  42.14 
 
 		 315 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.27 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>