126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4487 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  363  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  75.58 
 
 		 172 aa  293  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  75.58 
 
 		 172 aa  293  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  75.58 
 
 		 172 aa  293  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  75.58 
 
 		 172 aa  293  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  75 
 
 		 172 aa  291  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  73.84 
 
 		 172 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  72.35 
 
 		 171 aa  278  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  71.76 
 
 		 171 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  59.3 
 
 		 172 aa  234  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  59.88 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  60.36 
 
 		 171 aa  228  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.88 
 
 		 172 aa  225  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.88 
 
 		 172 aa  225  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.72 
 
 		 172 aa  224  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  58.72 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  58.72 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  58.72 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.72 
 
 		 172 aa  224  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.3 
 
 		 172 aa  224  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.72 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  58.48 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  58.72 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  58.14 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  57.56 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  56.98 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  58.14 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  58.14 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  56.4 
 
 		 172 aa  217  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  56.4 
 
 		 172 aa  217  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  57.56 
 
 		 172 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  57.56 
 
 		 172 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  57.56 
 
 		 172 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  58.14 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  55.56 
 
 		 171 aa  213  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  55.56 
 
 		 171 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  55.56 
 
 		 171 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  56.98 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  55.23 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  54.65 
 
 		 173 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  55.42 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  53.29 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  47.88 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  44.38 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  44.97 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  40.83 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  51.67 
 
 		 124 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  39.76 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.53 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  38.92 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.92 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  38.92 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  32.53 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.88 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.92 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.52 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.52 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  37.28 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  31.93 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.16 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  34.88 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.53 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  39.16 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.55 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  38.55 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.55 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  33.73 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  31.98 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  31.98 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.98 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.98 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.29 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  37.72 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  32.75 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  35.54 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.54 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.93 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.14 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  31.98 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  32.53 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.53 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.34 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.67 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  35.54 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.52 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  33.97 
 
 		 593 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>