124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0047 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 87 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  90.59 
 
 		 88 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1207  type III secretion protein HrcS  90.59 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.427882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  61.18 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  68.67 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  46.25 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  48.57 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  46.34 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  50.72 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  45.12 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  51.85 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  37.33 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  37.33 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  37.33 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  39.74 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  37.33 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  50 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  35.9 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  41.18 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  53.7 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  53.7 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  53.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0737  type III secretion protein, HrpO family  42.5 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0357891  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  37.14 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0273  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.59 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.941775  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  39.71 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0738  type III secretion protein, HrpO family  41.25 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0048  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.93 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0376  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  35.71 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  35.71 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  35.71 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  35.71 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  35.71 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  35.71 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0689  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.15 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0250879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  39.39 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  39.39 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  39.39 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  39.39 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  39.39 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0344  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.1 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0700  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.15 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0809641 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  33.8 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.1 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0663  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.15 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.242744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.03 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  45.45 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.18 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  46.15 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  41.07 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0770  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.14 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  41.94 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.31 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  39.47 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  41.79 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.27 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  41.79 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  41.79 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0282  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0700739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2032  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.29 
 
 		 90 aa  47.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.78 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.99 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.11 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.48 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.73 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  40 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.33 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1701  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.86 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.83 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1135  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.67 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1395  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.67 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.99 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  34.29 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4187  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.49 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.999442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.43 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.43 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.49 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1328  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.8 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.703831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2989  export protein FliQ  35.8 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  30.49 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.36 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.94 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1116  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.25 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  44.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.89 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.84 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.12 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.67 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2131  export protein FliQ  39.13 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>