More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1358 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
896 aa  1834    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
737 aa  270  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1068 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  51.35 
 
 
231 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
1090 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
1090 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
695 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
592 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
453 aa  180  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
661 aa  177  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.2 
 
 
1348 aa  177  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
627 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
581 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
460 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
489 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
608 aa  171  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
682 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
589 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
1222 aa  168  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
610 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
1009 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
456 aa  164  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
645 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
1043 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
605 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
583 aa  162  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
637 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
490 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
458 aa  161  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
607 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
587 aa  161  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
931 aa  161  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
882 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
444 aa  160  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
600 aa  160  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
984 aa  160  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
456 aa  160  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
695 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
606 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
680 aa  160  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
650 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
585 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
614 aa  158  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
436 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
827 aa  157  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  41.43 
 
 
927 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1393  histidine kinase  37.82 
 
 
380 aa  157  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.849343  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
612 aa  157  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1350 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
646 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
763 aa  156  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  36.33 
 
 
584 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  40 
 
 
617 aa  156  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
605 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  36.99 
 
 
599 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
599 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  38.34 
 
 
537 aa  155  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
920 aa  155  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
590 aa  155  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
582 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
371 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
781 aa  155  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
625 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
870 aa  154  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  32.87 
 
 
713 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  41.26 
 
 
356 aa  154  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
919 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
484 aa  153  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
1380 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  35.14 
 
 
571 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
584 aa  154  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
1126 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
584 aa  154  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
829 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
587 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
573 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
418 aa  153  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1226 aa  153  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
969 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  35.14 
 
 
571 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  37.82 
 
 
581 aa  152  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
1021 aa  152  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
664 aa  151  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
646 aa  151  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
1390 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1369 aa  151  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
1390 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  28.27 
 
 
648 aa  151  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  39.11 
 
 
465 aa  151  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
973 aa  150  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
587 aa  150  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  29.95 
 
 
1322 aa  150  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40 
 
 
587 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40 
 
 
587 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  40 
 
 
587 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  40 
 
 
587 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
469 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>