80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1823 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  44.38 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  39.52 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  39.07 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  36.57 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  39.61 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  36.42 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  34.46 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  38.97 
 
 		 390 aa  67.4  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.46 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  29.81 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  35.2 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  31.79 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  32.37 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  37.27 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  30.72 
 
 		 270 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  34.32 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  29.86 
 
 		 266 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  33.04 
 
 		 269 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  33 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  31.62 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  46.97 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  32.84 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  32.03 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  28.68 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.84 
 
 		 355 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 355 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  28.3 
 
 		 272 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  27.7 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  27.71 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  30.64 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  31.43 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  29.92 
 
 		 292 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 410 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  33.87 
 
 		 425 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  38.89 
 
 		 302 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  25.29 
 
 		 355 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  29.17 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  27.95 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  30.87 
 
 		 1177 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  31.01 
 
 		 216 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  31.21 
 
 		 267 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 346 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  30.15 
 
 		 269 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  30.58 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  29.61 
 
 		 269 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 422 aa  44.3  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  30.7 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  29.88 
 
 		 378 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  29.73 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  29.73 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  30.53 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  28.32 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  29.73 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  25.3 
 
 		 394 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  26.96 
 
 		 435 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  26.96 
 
 		 435 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  31.48 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  33.81 
 
 		 382 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  28.79 
 
 		 415 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.27 
 
 		 370 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.2 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  26.06 
 
 		 352 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  32.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  32.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  37.31 
 
 		 289 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  27.47 
 
 		 285 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  24.14 
 
 		 262 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01690  predicted Zn peptidase  31.75 
 
 		 246 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  32.31 
 
 		 271 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  32.31 
 
 		 271 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  28.83 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0468  helix-turn-helix domain protein  30.39 
 
 		 426 aa  41.2  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  27.33 
 
 		 246 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  40.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  30.09 
 
 		 395 aa  40.8  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>