12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01690  predicted Zn peptidase  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4018  hypothetical protein  38.92 
 
 		 194 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6931  protein of unknown function DUF955  37.43 
 
 		 187 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103363  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1825  hypothetical protein  29.34 
 
 		 448 aa  52  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  29.34 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  32.11 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  34.92 
 
 		 174 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  29.5 
 
 		 160 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  27.62 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 355 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  31.75 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.58 
 
 		 251 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>