83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0573 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  77.18 
 
 		 298 aa  487  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  76.51 
 
 		 298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  72.82 
 
 		 298 aa  454  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  31.68 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  32.8 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  32.8 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  31.35 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  32.48 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  31.83 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  30.72 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  30.65 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  31.15 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.3 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.16 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  30.26 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  30.06 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  30.26 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  30.26 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  30.56 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.62 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.8 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.76 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  30.87 
 
 		 337 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  29.53 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  30.72 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.03 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.89 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  29.77 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  29.93 
 
 		 337 aa  85.9  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.37 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  31.39 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  30.77 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  32.06 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  27.69 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  30.13 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.39 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.39 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  28.85 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  29.68 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  30.55 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  28.15 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  29.24 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  30.92 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.4 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.4 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.43 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  27.69 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.1 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.86 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.58 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  25.96 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.4 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  28.34 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  27.45 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  29.43 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.5 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  24.64 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.6 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  22.87 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  22.64 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  26.87 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.67 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.75 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  25.56 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.25 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  26.44 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.48 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  24.07 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  21.61 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  23.34 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  21.22 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  21.19 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0955  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.23 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50377  predicted protein  34.43 
 
 		 755 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  21.45 
 
 		 576 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  21.45 
 
 		 576 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>