More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4117 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  65.45 
 
 		 361 aa  497  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  62.75 
 
 		 357 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 357 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  61.41 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  53.35 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  51.57 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 359 aa  362  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 363 aa  358  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 358 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 363 aa  352  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 363 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 		 358 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 355 aa  352  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.72 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>