202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2986 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 412 aa  818    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  57.96 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  45.95 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  45.95 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  45.95 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  45.95 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  45.95 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  45.32 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  42.76 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  44.61 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  44.36 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  45.26 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  43.99 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  44.36 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  45.59 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  43.8 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  45.06 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  42.12 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  45.54 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  43.66 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  42.58 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  42.82 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  44.2 
 
 		 415 aa  322  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  43.46 
 
 		 421 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  43.54 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  43.17 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  45.24 
 
 		 389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  41.44 
 
 		 436 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  42.96 
 
 		 425 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  42.13 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  42.86 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  43.52 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  42.97 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  42.89 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  42.14 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  39.24 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  37.83 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  40.64 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  43.03 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  40.93 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  42.09 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  39.95 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  37.09 
 
 		 458 aa  265  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  39.24 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  35.19 
 
 		 432 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  36.56 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  37.72 
 
 		 413 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  35.66 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  41 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  38.61 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  38.61 
 
 		 408 aa  243  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.41 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  35.05 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  34.39 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  35.24 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  31.55 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  33.18 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  33.64 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  34.35 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  32.34 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  30.73 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  33.09 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  33.09 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  33.09 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  33.09 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  33.09 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  32.48 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  31.19 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  32.85 
 
 		 438 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  32.77 
 
 		 438 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  29.53 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  29.44 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  31.64 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  32.62 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  29.75 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  32.92 
 
 		 433 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  30.86 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  29.93 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  28.64 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  30.33 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  29.4 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  29.38 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  31.39 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  29.57 
 
 		 474 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  28.74 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  29.38 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  29.38 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  28.2 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  30.5 
 
 		 407 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  31.29 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>