More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2458 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  50.07 
 
 
688 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  51.26 
 
 
695 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  62.57 
 
 
719 aa  909    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  62.39 
 
 
723 aa  895    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  53.41 
 
 
701 aa  692    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  64.35 
 
 
719 aa  924    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  51.41 
 
 
689 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  55.6 
 
 
685 aa  768    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  51.01 
 
 
689 aa  695    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  51.48 
 
 
688 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  65.59 
 
 
700 aa  955    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  63.34 
 
 
724 aa  905    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  50.14 
 
 
703 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  51.63 
 
 
703 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  62.61 
 
 
708 aa  915    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  59.14 
 
 
677 aa  817    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  57.08 
 
 
679 aa  802    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  64.22 
 
 
730 aa  922    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  50.07 
 
 
688 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
713 aa  1469    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  48.53 
 
 
685 aa  633  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  46.38 
 
 
745 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  47.29 
 
 
685 aa  620  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  48.19 
 
 
696 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  43.88 
 
 
727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  45.24 
 
 
729 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  44.15 
 
 
718 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  43.88 
 
 
727 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  43.88 
 
 
727 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  43.94 
 
 
726 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  45.15 
 
 
718 aa  602  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  46 
 
 
719 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  45.52 
 
 
682 aa  592  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  43.98 
 
 
714 aa  591  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.36 
 
 
710 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  45.89 
 
 
719 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  44.49 
 
 
727 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  44.35 
 
 
727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  44.35 
 
 
727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  44.35 
 
 
727 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  43.26 
 
 
718 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  44.54 
 
 
711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.44 
 
 
719 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  39.51 
 
 
714 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  39.04 
 
 
670 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  37.55 
 
 
707 aa  485  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.03 
 
 
726 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.24 
 
 
1283 aa  448  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  36 
 
 
703 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  35.45 
 
 
666 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  35.88 
 
 
690 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.09 
 
 
690 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  35.97 
 
 
697 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  36.07 
 
 
713 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.49 
 
 
702 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.72 
 
 
740 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  32.86 
 
 
692 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  33.81 
 
 
709 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  34.51 
 
 
723 aa  376  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  31.65 
 
 
705 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  34.34 
 
 
717 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  33.85 
 
 
742 aa  355  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  33.8 
 
 
704 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00350  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 
811 aa  303  6.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  29.73 
 
 
686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  28.53 
 
 
803 aa  279  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  30.67 
 
 
697 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 
718 aa  267  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  28.96 
 
 
733 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  28.78 
 
 
688 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  29.28 
 
 
721 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.55 
 
 
704 aa  260  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  30.07 
 
 
701 aa  260  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
697 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  29.77 
 
 
697 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  29.67 
 
 
697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  29.67 
 
 
697 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  29.67 
 
 
697 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
697 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
734 aa  253  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  29.19 
 
 
697 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  28.65 
 
 
732 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  29.6 
 
 
695 aa  248  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  30.28 
 
 
696 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 
614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  27.44 
 
 
699 aa  242  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  26.91 
 
 
678 aa  240  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
730 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.21 
 
 
682 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  26.87 
 
 
696 aa  233  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  27.22 
 
 
686 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  27.78 
 
 
688 aa  230  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  28.07 
 
 
705 aa  230  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  40 
 
 
696 aa  227  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  27.43 
 
 
701 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  26.21 
 
 
683 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.69 
 
 
697 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
690 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.18 
 
 
671 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  26.35 
 
 
683 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>