More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2044 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  100 
 
 		 608 aa  1249    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  46.57 
 
 		 697 aa  535  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  46.1 
 
 		 689 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  43.25 
 
 		 721 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 		 701 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  43.56 
 
 		 768 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  43.83 
 
 		 686 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  41.2 
 
 		 799 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  40.8 
 
 		 675 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  38.88 
 
 		 707 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  39.59 
 
 		 729 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  39.01 
 
 		 719 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  40.23 
 
 		 722 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  38.59 
 
 		 712 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  41.13 
 
 		 731 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  38.94 
 
 		 754 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  40.37 
 
 		 620 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  40.9 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  37.73 
 
 		 746 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  41.13 
 
 		 731 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  40.88 
 
 		 729 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  40.88 
 
 		 729 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  40.88 
 
 		 729 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  38.52 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  40.88 
 
 		 729 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  40.72 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  40.88 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  40.1 
 
 		 729 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  40.26 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  41.26 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  40.68 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 869 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 869 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 869 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 869 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 869 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 869 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 906 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  37.48 
 
 		 854 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  36.91 
 
 		 873 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  38.08 
 
 		 697 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  36.69 
 
 		 877 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  37.46 
 
 		 891 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  37 
 
 		 867 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  37.3 
 
 		 865 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  37.3 
 
 		 865 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 865 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  37.13 
 
 		 865 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  37.13 
 
 		 865 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  37.13 
 
 		 865 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  37.13 
 
 		 865 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.2 
 
 		 573 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  36.85 
 
 		 896 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  37.42 
 
 		 839 aa  362  9e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  38.31 
 
 		 846 aa  362  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  35.98 
 
 		 891 aa  361  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  37.28 
 
 		 876 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  38.15 
 
 		 730 aa  359  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  36.81 
 
 		 908 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  36.69 
 
 		 876 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  36.63 
 
 		 888 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  35.92 
 
 		 714 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  36.63 
 
 		 889 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  36.64 
 
 		 718 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  35.79 
 
 		 939 aa  349  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  37.17 
 
 		 869 aa  348  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  35.03 
 
 		 876 aa  348  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  34.93 
 
 		 920 aa  347  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 714 aa  346  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  35.57 
 
 		 714 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  37.19 
 
 		 980 aa  341  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  36.16 
 
 		 981 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  35.97 
 
 		 1002 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  35.92 
 
 		 990 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  36.02 
 
 		 982 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  36.83 
 
 		 681 aa  337  5.999999999999999e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 981 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  36.2 
 
 		 851 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  36.2 
 
 		 975 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  36.16 
 
 		 879 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  34.61 
 
 		 741 aa  330  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  34.17 
 
 		 777 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  34.92 
 
 		 711 aa  326  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  34.92 
 
 		 711 aa  326  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  32.53 
 
 		 655 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  34.33 
 
 		 992 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  40.12 
 
 		 689 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  34.43 
 
 		 744 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 655 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  34.38 
 
 		 920 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  34.97 
 
 		 711 aa  317  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>