More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0688 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
159 aa  332  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  59.65 
 
 
169 aa  199  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.94 
 
 
338 aa  177  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.26 
 
 
351 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.38 
 
 
290 aa  170  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.93 
 
 
334 aa  170  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.65 
 
 
334 aa  169  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  66.39 
 
 
124 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.18 
 
 
287 aa  167  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.56 
 
 
284 aa  167  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  68.1 
 
 
119 aa  167  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.66 
 
 
333 aa  167  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  67.24 
 
 
119 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  66.38 
 
 
119 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  65.83 
 
 
120 aa  165  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
124 aa  164  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.71 
 
 
306 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.95 
 
 
305 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.16 
 
 
300 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
121 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.93 
 
 
286 aa  155  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.72 
 
 
301 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.72 
 
 
301 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.72 
 
 
301 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.87 
 
 
301 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.83 
 
 
301 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.83 
 
 
301 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.83 
 
 
301 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.83 
 
 
302 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.83 
 
 
301 aa  153  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.18 
 
 
301 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.5 
 
 
305 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.95 
 
 
301 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.9 
 
 
289 aa  143  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.9 
 
 
289 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.46 
 
 
309 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  44.44 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  48.15 
 
 
148 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  48.53 
 
 
136 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.37 
 
 
284 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.37 
 
 
284 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 
146 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  52.46 
 
 
136 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 
136 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 
146 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 
136 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  53.28 
 
 
136 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  51.13 
 
 
134 aa  120  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  49.18 
 
 
136 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  48 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  48.36 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  47.97 
 
 
133 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  46.51 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.54 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  39.33 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  47.9 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  46.21 
 
 
135 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  42.59 
 
 
166 aa  107  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  44.63 
 
 
140 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  43.07 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  49.21 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  45.83 
 
 
171 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  46.22 
 
 
148 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  43.75 
 
 
142 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  43.26 
 
 
154 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  46.51 
 
 
137 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  47.11 
 
 
128 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  43.18 
 
 
141 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  46.51 
 
 
137 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  46.51 
 
 
137 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 
141 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  43.28 
 
 
153 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  47.54 
 
 
150 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 
133 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  46.72 
 
 
133 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  44.85 
 
 
137 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  49.21 
 
 
136 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  41.22 
 
 
148 aa  103  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  48.7 
 
 
154 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  45.38 
 
 
133 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  44.26 
 
 
418 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  42.75 
 
 
147 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  41.79 
 
 
142 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  34.88 
 
 
171 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  48.74 
 
 
134 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  40.91 
 
 
141 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  41.67 
 
 
140 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  46.22 
 
 
142 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  44.35 
 
 
127 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  55.68 
 
 
153 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  43.09 
 
 
145 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  41.79 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  46.28 
 
 
161 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  45.76 
 
 
178 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  48.41 
 
 
136 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  43.38 
 
 
137 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  43.38 
 
 
137 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  43.38 
 
 
137 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  43.38 
 
 
137 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>