98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4047 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  44.97 
 
 		 596 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  32.52 
 
 		 220 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  34.42 
 
 		 403 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  39.33 
 
 		 281 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 643 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  29.05 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  27.69 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  33.64 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  31.73 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  29.22 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  37.89 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  39.36 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4041  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.692603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1124 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.62 
 
 		 764 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  29.14 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  29.53 
 
 		 1673 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  35 
 
 		 712 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  22.75 
 
 		 219 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  27.49 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2060  hypothetical protein  38.18 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.572806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  25.12 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1396  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.37 
 
 		 242 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.47 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3184  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 367 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  29.55 
 
 		 500 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 678 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2394  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2311  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2582  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000580379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2569  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2379  hypothetical protein  26.62 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  30.91 
 
 		 172 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  34 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 197 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2539  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 634 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3799  hypothetical protein  30.11 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  29.29 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  42.37 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  36.76 
 
 		 417 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  45.76 
 
 		 507 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 209 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 710 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2349  hypothetical protein  34.02 
 
 		 186 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000150193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  34.33 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  35.35 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  43.75 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2765  hypothetical protein  29.29 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 241 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 241 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  36.92 
 
 		 241 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>