More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2974 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  100 
 
 		 477 aa  994    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  78.36 
 
 		 485 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  56.14 
 
 		 476 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  55.93 
 
 		 476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  56.57 
 
 		 476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  56.14 
 
 		 476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  56.96 
 
 		 477 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  54.45 
 
 		 476 aa  541  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  36.3 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.45 
 
 		 470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 461 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  30.18 
 
 		 473 aa  196  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.87 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 		 462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 450 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 452 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  32.59 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 403 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 728 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.8 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.94 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.96 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 474 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 470 aa  93.6  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  25.13 
 
 		 370 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.92 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 507 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 351 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 397 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  26.11 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  26.11 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 370 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.7 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  24.3 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  25.87 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25.22 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 800 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.04 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.04 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  29.17 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.04 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  25.28 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.71 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>