178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3569 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3569  formamidase  100 
 
 		 408 aa  841    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  69.21 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  71.43 
 
 		 410 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  70.82 
 
 		 411 aa  599  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  71.64 
 
 		 408 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  72.15 
 
 		 410 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  71.28 
 
 		 409 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  69.92 
 
 		 409 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  69.67 
 
 		 410 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  71.28 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  69.92 
 
 		 412 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  69.92 
 
 		 412 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  70.53 
 
 		 409 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  69.92 
 
 		 412 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  70.53 
 
 		 409 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  69 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  71.28 
 
 		 409 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  69.17 
 
 		 409 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  70.28 
 
 		 409 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  68.42 
 
 		 410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  69.17 
 
 		 410 aa  567  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  67.51 
 
 		 397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  68.34 
 
 		 410 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  69.62 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  69.42 
 
 		 409 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  68.17 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  68.17 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  60.34 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  58.42 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  57.86 
 
 		 416 aa  495  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  56.14 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  57.64 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  57.7 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  55.16 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  55.16 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  57.18 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  55.16 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  55.88 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  55.64 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  56.83 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  53.46 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  55.7 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  52.04 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  47.06 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  61.2 
 
 		 206 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  34.01 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  36.36 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.65 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  31.33 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.57 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.42 
 
 		 328 aa  136  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.38 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.38 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.38 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.61 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.27 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28.77 
 
 		 314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  27.47 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  26.58 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.45 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  28.57 
 
 		 224 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  28.18 
 
 		 314 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  29.21 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.67 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.33 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  27.33 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.34 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  27.76 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  27.55 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  27.76 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  30.61 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  27.91 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.83 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.17 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.76 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  26.87 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  24.42 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  27.35 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  25.38 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.3 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  26.85 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  27.93 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  25.34 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  32.49 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  24.47 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  26.37 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  27.01 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  24.76 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  27.7 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  30.45 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.02 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  28.18 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.71 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.26 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  27.72 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  29.25 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>