166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2057 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 834 aa  1711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.7 
 
 		 778 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.87 
 
 		 778 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.02 
 
 		 807 aa  205  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  26.02 
 
 		 814 aa  205  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  26.56 
 
 		 754 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.1 
 
 		 734 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.41 
 
 		 775 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.39 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.83 
 
 		 798 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  25.87 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  27.01 
 
 		 790 aa  181  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.85 
 
 		 778 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  27.01 
 
 		 790 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.75 
 
 		 834 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  24.83 
 
 		 786 aa  174  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.25 
 
 		 791 aa  172  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.55 
 
 		 788 aa  170  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  23.06 
 
 		 788 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  26.26 
 
 		 842 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.77 
 
 		 849 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.07 
 
 		 748 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  25.25 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.25 
 
 		 789 aa  165  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  25.14 
 
 		 810 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.82 
 
 		 816 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  25.14 
 
 		 803 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  25.14 
 
 		 782 aa  163  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  25.18 
 
 		 803 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  24.34 
 
 		 766 aa  161  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.88 
 
 		 808 aa  161  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  22.42 
 
 		 815 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.42 
 
 		 815 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  22.42 
 
 		 815 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  26.76 
 
 		 766 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  26.76 
 
 		 766 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.89 
 
 		 781 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  26.76 
 
 		 766 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.72 
 
 		 797 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  23.98 
 
 		 765 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  26.62 
 
 		 803 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.5 
 
 		 797 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  26.62 
 
 		 766 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  26.62 
 
 		 766 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.54 
 
 		 765 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.45 
 
 		 785 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.63 
 
 		 778 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  26.81 
 
 		 984 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.21 
 
 		 790 aa  147  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.7 
 
 		 786 aa  144  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.87 
 
 		 794 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  23.09 
 
 		 804 aa  134  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.96 
 
 		 782 aa  116  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  23.18 
 
 		 840 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  25.7 
 
 		 872 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.11 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.04 
 
 		 930 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  24.79 
 
 		 851 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.16 
 
 		 828 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  23.34 
 
 		 939 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  24.5 
 
 		 888 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  23.23 
 
 		 914 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.02 
 
 		 851 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  24.5 
 
 		 873 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  23.08 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  24.23 
 
 		 836 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  24.5 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  23.08 
 
 		 913 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.05 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  24.36 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.16 
 
 		 880 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  22.84 
 
 		 842 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25.18 
 
 		 836 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.81 
 
 		 851 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  23.99 
 
 		 888 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  23.16 
 
 		 842 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  23.16 
 
 		 842 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3335  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.51 
 
 		 804 aa  62  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322064  normal  0.349382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  23.73 
 
 		 836 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.88 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.93 
 
 		 1040 aa  60.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03367  P pilus assembly protein, porin PapC  22.34 
 
 		 796 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  21.4 
 
 		 863 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  21.96 
 
 		 809 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.29 
 
 		 859 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  20.55 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  20.78 
 
 		 864 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  21.96 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  21.96 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  21.96 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  21.96 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  24.59 
 
 		 836 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.34 
 
 		 836 aa  58.9  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.85 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.87 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.16 
 
 		 865 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  21.7 
 
 		 838 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.94 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.11 
 
 		 838 aa  57  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  21.26 
 
 		 838 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>