More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1876 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  100 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  43.54 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.23 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.61 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  46 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  39.11 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  40.59 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  35.1 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  33.01 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.68 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  36.02 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  32.35 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.69 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.98 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.01 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  28.3 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  25.91 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.67 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.98 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  29.32 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  30.63 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  42.68 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  32.29 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.42 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.22 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  30.5 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  24.64 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.43 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.34 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  25.24 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  23.72 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  23.19 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  28.63 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.98 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  23.04 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.63 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  31.15 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.63 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.03 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  27.03 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  27.03 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  27.03 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  27.03 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.98 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  26.92 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  26.92 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  26.92 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  25 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.23 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  25.28 
 
 		 965 aa  58.5  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  30.29 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.78 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  28.27 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  27.66 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  27.66 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  38.54 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  27.66 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  28.65 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.3 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  31.19 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  29.57 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  24.51 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  24.34 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>