51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0191 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  100 
 
 		 811 aa  1597    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  38.02 
 
 		 837 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  38.04 
 
 		 851 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  37.93 
 
 		 840 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  37.2 
 
 		 851 aa  482  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  39.82 
 
 		 826 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  39.75 
 
 		 834 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  37.01 
 
 		 830 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  37.47 
 
 		 843 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  38.84 
 
 		 836 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  38.53 
 
 		 836 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  39.66 
 
 		 829 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  37.09 
 
 		 826 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  40.2 
 
 		 829 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  39.92 
 
 		 829 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  36.12 
 
 		 821 aa  326  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  32.58 
 
 		 807 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  33.67 
 
 		 819 aa  303  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  33.69 
 
 		 817 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  35.61 
 
 		 676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  34.98 
 
 		 638 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  30.96 
 
 		 818 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  34.33 
 
 		 820 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  32.78 
 
 		 838 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  32.95 
 
 		 851 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  31.37 
 
 		 835 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.27 
 
 		 878 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  30.77 
 
 		 837 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  28.52 
 
 		 1209 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.24 
 
 		 1209 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.09 
 
 		 1237 aa  194  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  34.29 
 
 		 651 aa  185  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  27.29 
 
 		 1224 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  27.01 
 
 		 1224 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.89 
 
 		 1224 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32.78 
 
 		 476 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.54 
 
 		 366 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  34.67 
 
 		 638 aa  101  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  36.46 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  32.65 
 
 		 2620 aa  62  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  33.11 
 
 		 2358 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  33.11 
 
 		 2296 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  32.43 
 
 		 2367 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  33.11 
 
 		 2358 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  32.43 
 
 		 2383 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 1050 aa  53.5  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  29.9 
 
 		 1075 aa  53.5  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  29.9 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  37.84 
 
 		 609 aa  51.2  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  28.9 
 
 		 1084 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  26.77 
 
 		 951 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>