More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03589 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  100 
 
 		 393 aa  766    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  37.94 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  35.2 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  37.97 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  35.83 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  29.33 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  36.44 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  32.39 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  28.23 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  33.78 
 
 		 391 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  30.34 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.97 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  30.45 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  30.18 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.72 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.72 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.5 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  31.3 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  27.15 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  24.34 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  25.06 
 
 		 371 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25.46 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.79 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  26.82 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  25.08 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.13 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  24.92 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  25.13 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  26.07 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  27.83 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.06 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  28.74 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  28.74 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  28.74 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  28.74 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  27.88 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.35 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  27.14 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  29.92 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  28.46 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  30.6 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  28.67 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  29.8 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  28.38 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  29.39 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.91 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  25.95 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  27.57 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  26.94 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  22.34 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  24.53 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.65 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  36.92 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  25.67 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.78 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  30.7 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  24.52 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  27.74 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2523  kynureninase  25.21 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000799329  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  23.71 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  31.98 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2559  kynureninase  26.05 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0488118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2787  kynureninase  26.92 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00906384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2567  kynureninase  25.21 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2488  kynureninase  25.21 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.819206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2753  kynureninase  25.21 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  28.16 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2761  kynureninase  25.21 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.92 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.45 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  25.63 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  29.54 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.05 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.69 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.69 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  26.85 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.69 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  25.96 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  28.38 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  33.46 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  28.78 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.19 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.56 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  27.93 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  23.6 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  24.46 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  27.93 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  27.93 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.3 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  29.34 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  27.93 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  27.93 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  27.33 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>