More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3052 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  100 
 
 
413 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  81.77 
 
 
419 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  79.8 
 
 
419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  65.11 
 
 
434 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  62.8 
 
 
433 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  64.95 
 
 
434 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  62.8 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  65.51 
 
 
436 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  64.6 
 
 
434 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  64.63 
 
 
412 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  54.63 
 
 
415 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  40.35 
 
 
425 aa  292  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  42.93 
 
 
410 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  34.75 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  36.27 
 
 
418 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  34.56 
 
 
416 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  35.35 
 
 
426 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  35.66 
 
 
462 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  35.35 
 
 
417 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  34.98 
 
 
416 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  35.29 
 
 
416 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  35.73 
 
 
420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.68 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
407 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  28.28 
 
 
455 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.44 
 
 
439 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.45 
 
 
415 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.14 
 
 
399 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.03 
 
 
415 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.87 
 
 
399 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  30.3 
 
 
415 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  24.7 
 
 
441 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  29.75 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.08 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
433 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.47 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.47 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.47 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.47 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
451 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.43 
 
 
399 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.47 
 
 
399 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.68 
 
 
433 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.81 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.47 
 
 
399 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.71 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.76 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.33 
 
 
428 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.33 
 
 
428 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.33 
 
 
428 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.13 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.4 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.08 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.87 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
429 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  29.09 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  29.09 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.99 
 
 
431 aa  89.7  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
425 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  29.39 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  31.4 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  29.05 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  34.11 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.71 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  34.11 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.77 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  33.21 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.3 
 
 
432 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.3 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.39 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  24.32 
 
 
405 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.32 
 
 
405 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
398 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  27.35 
 
 
381 aa  87  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  24.32 
 
 
405 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.45 
 
 
435 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
416 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
406 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  32.97 
 
 
446 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.3 
 
 
432 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  32.97 
 
 
446 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  32.97 
 
 
441 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  32.97 
 
 
458 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  32.97 
 
 
446 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  32.97 
 
 
446 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  32.97 
 
 
458 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  26.09 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>