104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2446 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 
296 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  84.8 
 
 
291 aa  466  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  68.82 
 
 
293 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  67.8 
 
 
293 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  60.14 
 
 
294 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  67.28 
 
 
299 aa  361  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  60.85 
 
 
293 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  56.61 
 
 
295 aa  357  1e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  56.61 
 
 
295 aa  357  1e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  56.27 
 
 
295 aa  356  3e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  61.34 
 
 
293 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  62.09 
 
 
444 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  61.87 
 
 
395 aa  352  6e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  61.79 
 
 
486 aa  352  6e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  61.79 
 
 
404 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  61.87 
 
 
404 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  61.79 
 
 
404 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  61.79 
 
 
404 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  61.79 
 
 
395 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  58.36 
 
 
291 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  58.52 
 
 
291 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  58.82 
 
 
291 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  56.61 
 
 
295 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  56.61 
 
 
295 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  59.79 
 
 
292 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  52.7 
 
 
299 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 
307 aa  320  2e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 
307 aa  320  2e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  55.02 
 
 
307 aa  320  2e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  55.02 
 
 
307 aa  320  2e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  54.38 
 
 
299 aa  319  4e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  54.01 
 
 
299 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  54.01 
 
 
299 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  54.28 
 
 
307 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  52.07 
 
 
287 aa  311  6e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  54.14 
 
 
303 aa  307  1e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  50.75 
 
 
317 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  50.75 
 
 
317 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  51.4 
 
 
283 aa  284  1e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  46.6 
 
 
289 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 
293 aa  254  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  44.79 
 
 
292 aa  254  1e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  46.69 
 
 
298 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  41.16 
 
 
304 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  40.91 
 
 
288 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  43.1 
 
 
293 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 
288 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.39 
 
 
299 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 
266 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 
273 aa  172  7e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  35.85 
 
 
273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  35.09 
 
 
293 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  35.08 
 
 
292 aa  155  5e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  30.83 
 
 
302 aa  114  1e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 
301 aa  72.8  7e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 
278 aa  67.4  3e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  27.24 
 
 
526 aa  65.9  8e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 
274 aa  65.1  1e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  23.47 
 
 
299 aa  65.5  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
318 aa  61.6  1e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
246 aa  60.5  4e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
312 aa  56.6  5e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.28 
 
 
291 aa  56.6  5e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.35 
 
 
319 aa  54.7  2e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
246 aa  52  1e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
249 aa  50.1  4e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
246 aa  50.1  5e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  23.32 
 
 
298 aa  49.3  9e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.33 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.46 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.78 
 
 
321 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.89 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  23.58 
 
 
319 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
336 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.85 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.89 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  21.79 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  21.11 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>