118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3833 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 344 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  32.34 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  32.34 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.85 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  31.68 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.39 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.85 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.2 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.84 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.19 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.61 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  29.91 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  22.06 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.37 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  36 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.7 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.93 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.39 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  28.31 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.41 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  39.73 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.42 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  25.23 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 300 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.5 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.1 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  27.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  22.58 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 307 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  25.36 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>