89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1528 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  893    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  45.43 
 
 
431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  36.66 
 
 
445 aa  282  9e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  32.29 
 
 
398 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  30.18 
 
 
406 aa  179  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  28.48 
 
 
418 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  29.83 
 
 
399 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  28.35 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  28.01 
 
 
423 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  25.25 
 
 
437 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  29.18 
 
 
423 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  29.67 
 
 
420 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  29.67 
 
 
431 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  28.27 
 
 
431 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  28.51 
 
 
429 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  29.7 
 
 
423 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  28.74 
 
 
423 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  25.25 
 
 
466 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.17 
 
 
427 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  25.93 
 
 
430 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  23.34 
 
 
396 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  27.27 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  26.42 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  26.86 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  29.25 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  25.71 
 
 
414 aa  90.5  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  27.71 
 
 
430 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  28.91 
 
 
428 aa  89.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  27.54 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  25.53 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  24.66 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  26.63 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  26.63 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  27.15 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  24.13 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  27.08 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  25.15 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.15 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.13 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.96 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  24.94 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.18 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  29.24 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  25.42 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.43 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  23.89 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.6 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.39 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  30 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.47 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.33 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  23.97 
 
 
410 aa  64.7  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  23.84 
 
 
360 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  25.68 
 
 
434 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  28.42 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.79 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  21.8 
 
 
542 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.59 
 
 
485 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  23.1 
 
 
462 aa  57  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  27.14 
 
 
339 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  23.72 
 
 
477 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  25.52 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  23.55 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  25.51 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.21 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.8 
 
 
427 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.8 
 
 
427 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.04 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.08 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  29.61 
 
 
196 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.89 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  20.65 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  20 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  23.36 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  27.8 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  26.48 
 
 
392 aa  47  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  22.04 
 
 
412 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  20.36 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.4 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.64 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  23.21 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  19.46 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.61 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  20.74 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  22.17 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  27.34 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.3 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  26.32 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>