38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0142 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
159 aa  328  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  50.34 
 
 
418 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  49.32 
 
 
406 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  48.28 
 
 
398 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  35.66 
 
 
399 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  30 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  28.74 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  40.22 
 
 
423 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  31.08 
 
 
466 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  29.58 
 
 
396 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  35.57 
 
 
421 aa  57.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  29.69 
 
 
431 aa  57.4  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  35.2 
 
 
427 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  34.51 
 
 
428 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  32.14 
 
 
431 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  32.14 
 
 
420 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  35.4 
 
 
428 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  30.67 
 
 
432 aa  54.3  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  27.22 
 
 
445 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  33.64 
 
 
437 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  31.45 
 
 
471 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  31.2 
 
 
426 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  27.78 
 
 
428 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  27.78 
 
 
424 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  32.46 
 
 
429 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  30.07 
 
 
423 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  27.46 
 
 
423 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  27.88 
 
 
427 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  35.44 
 
 
392 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  29.77 
 
 
434 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.57 
 
 
423 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  26.57 
 
 
423 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  29.68 
 
 
410 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  35.23 
 
 
403 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  30.86 
 
 
425 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  31.17 
 
 
414 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  30.94 
 
 
435 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  28.45 
 
 
542 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>