71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0505 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
196 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  99.49 
 
 
196 aa  410  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  75.13 
 
 
200 aa  313  1e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  62.5 
 
 
196 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.85 
 
 
205 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  38.83 
 
 
190 aa  134  7e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  37.17 
 
 
194 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  37.77 
 
 
196 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.04 
 
 
545 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 
210 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  35.75 
 
 
218 aa  115  4e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.55 
 
 
544 aa  113  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.22 
 
 
550 aa  113  2e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  34.74 
 
 
218 aa  111  7e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  34.25 
 
 
204 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  31.89 
 
 
255 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  35.11 
 
 
214 aa  108  7e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.97 
 
 
208 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  32.31 
 
 
214 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  32.07 
 
 
212 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 
598 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.87 
 
 
559 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  32.99 
 
 
214 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  31.34 
 
 
215 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  33.7 
 
 
199 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.81 
 
 
570 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  30.16 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.61 
 
 
214 aa  97.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.97 
 
 
212 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.91 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.74 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  8.54832e-05  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  31.5 
 
 
225 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.49 
 
 
553 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  30.85 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  33.86 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  29 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.47 
 
 
219 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  32 
 
 
223 aa  95.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.43 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.19 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  28.64 
 
 
222 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  27.54 
 
 
333 aa  92  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.54 
 
 
580 aa  92  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  31.55 
 
 
210 aa  91.3  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  31.05 
 
 
218 aa  91.3  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.5 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.55 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.72 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.89 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.57 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  27.32 
 
 
190 aa  81.6  7e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.26 
 
 
218 aa  81.3  9e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  27.91 
 
 
594 aa  79.3  3e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  29.15 
 
 
234 aa  78.6  5e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.98 
 
 
558 aa  76.3  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.98 
 
 
190 aa  76.3  3e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.63 
 
 
198 aa  59.7  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.19 
 
 
190 aa  56.2  3e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  25.81 
 
 
189 aa  55.5  4e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.61 
 
 
198 aa  52.8  3e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  27.5 
 
 
170 aa  51.2  9e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.87 
 
 
204 aa  50.8  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.58 
 
 
197 aa  48.9  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  20.74 
 
 
202 aa  48.9  5e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  28.7 
 
 
170 aa  48.1  8e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  26.42 
 
 
169 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  26.09 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.1 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.95 
 
 
197 aa  45.1  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  20.94 
 
 
206 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>