More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3921 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  100 
 
 
445 aa  928    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  45.36 
 
 
440 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  40.77 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  40.71 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  40.83 
 
 
428 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  40.31 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  38.9 
 
 
427 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  38.5 
 
 
429 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  39.84 
 
 
423 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  38.25 
 
 
431 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  38.87 
 
 
430 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.52 
 
 
428 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  23.63 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  22.8 
 
 
438 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.4 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.66 
 
 
393 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  24.57 
 
 
399 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  26.01 
 
 
433 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  24.68 
 
 
388 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  23.28 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  22.02 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.87 
 
 
415 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  21.58 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  25.07 
 
 
462 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  24.69 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  21.23 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  22.49 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  22.49 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  22.19 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  22.49 
 
 
464 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  22.49 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  22.85 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  23.66 
 
 
394 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  22.14 
 
 
368 aa  93.6  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  22.19 
 
 
385 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  25.54 
 
 
390 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  23.39 
 
 
376 aa  93.2  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  23.98 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  20.82 
 
 
388 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  22.19 
 
 
389 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  22.19 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  22.54 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.62 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  23.82 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  23.72 
 
 
382 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  23.97 
 
 
880 aa  89.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.38 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.11 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.94 
 
 
376 aa  87.8  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  22.06 
 
 
896 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  23.02 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  24.65 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  23.1 
 
 
470 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.49 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  22.85 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.83 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  21.6 
 
 
384 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  21.35 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.68 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  21.28 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  23.48 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.76 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  22.34 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.94 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  24.43 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  23.83 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  21.31 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  23.83 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  23.58 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  23.58 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  23.83 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  23.58 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.58 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  23.83 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  22.73 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  24.13 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  20.06 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.83 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  21.71 
 
 
879 aa  80.9  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  23.58 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  24.29 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  23.6 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.8 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl248  selenocysteine lyase, class V pyridoxal phosphate aminotransferase, cysteine desulfurase  22.51 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00113755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  23.23 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.31 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  23.75 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  20.26 
 
 
885 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  24.23 
 
 
878 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.75 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  19.46 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  22.68 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  23.51 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  23.64 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  24.62 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  22.65 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  22.01 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.01 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  24.56 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  23.79 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>