More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  100 
 
 
341 aa  691  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  99.12 
 
 
341 aa  685  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  74.71 
 
 
340 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  74.12 
 
 
340 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  72.11 
 
 
339 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  71.81 
 
 
339 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  72.11 
 
 
339 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  74.41 
 
 
340 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  71.51 
 
 
339 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  73.45 
 
 
342 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  74.41 
 
 
339 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  49.72 
 
 
365 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  52.52 
 
 
337 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.82338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  53.41 
 
 
353 aa  359  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.85162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  52.72 
 
 
347 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  53.44 
 
 
338 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  53.12 
 
 
338 aa  338  9e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  51.6 
 
 
348 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  51.6 
 
 
348 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  51.6 
 
 
348 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  48.35 
 
 
343 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.80746e-07  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  46.85 
 
 
336 aa  332  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  50.61 
 
 
353 aa  331  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  48.98 
 
 
348 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  48.42 
 
 
353 aa  329  5e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.39e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  52.27 
 
 
334 aa  328  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  50.45 
 
 
340 aa  328  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  49.86 
 
 
349 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  47.75 
 
 
343 aa  328  1e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  47.59 
 
 
337 aa  326  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.73214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  51.2 
 
 
342 aa  325  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.59076e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  49.85 
 
 
338 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.34628e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  50.73 
 
 
348 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  2.88065e-08 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  49.56 
 
 
348 aa  321  1e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  50.15 
 
 
338 aa  319  4e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01356e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  50.86 
 
 
353 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.8636e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  51.24 
 
 
347 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  46.69 
 
 
356 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  47.51 
 
 
349 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  50.87 
 
 
349 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  3.87336e-07 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
324 aa  316  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  50.87 
 
 
349 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  50.3 
 
 
338 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  50.87 
 
 
349 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40347e-14 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  50.87 
 
 
349 aa  315  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  50.87 
 
 
349 aa  315  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80069e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  50.87 
 
 
349 aa  315  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  48.15 
 
 
348 aa  315  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  50.15 
 
 
338 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  50.58 
 
 
349 aa  314  2e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
338 aa  313  3e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  48.28 
 
 
348 aa  312  5e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  49.43 
 
 
353 aa  312  5e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
338 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  58.76 
 
 
349 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  52.25 
 
 
330 aa  308  6e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.78362e-06  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  50.29 
 
 
349 aa  308  6e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
338 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  50.15 
 
 
338 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.22492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  61.67 
 
 
326 aa  304  2e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  51.31 
 
 
347 aa  303  3e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53353e-05 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  59.49 
 
 
332 aa  301  7e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  6.96502e-10 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  47.55 
 
 
344 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  47.71 
 
 
325 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  49.25 
 
 
343 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.70796e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  50.64 
 
 
335 aa  299  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  50 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  50 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  50 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17623e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  50 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37079e-13 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  49.85 
 
 
347 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  49.71 
 
 
348 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.383e-07 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  48.92 
 
 
334 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  48.92 
 
 
334 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  48.89 
 
 
312 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  50.5 
 
 
312 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  49.21 
 
 
332 aa  285  1e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  46.75 
 
 
333 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  54.26 
 
 
234 aa  220  2e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  50 
 
 
216 aa  201  2e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  42.42 
 
 
165 aa  127  4e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.11 
 
 
547 aa  99.8  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.36 
 
 
596 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  31.38 
 
 
609 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  5.32675e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.7 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 
596 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.62 
 
 
590 aa  89.4  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  3.75913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  38.89 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  34.87 
 
 
611 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.13 
 
 
595 aa  86.3  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.6 
 
 
584 aa  85.1  1e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  33.17 
 
 
300 aa  84.7  2e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.44 
 
 
336 aa  84.3  2e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.34 
 
 
629 aa  84.7  2e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.51 
 
 
640 aa  84  3e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.9 
 
 
383 aa  84.3  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  33.33 
 
 
267 aa  83.6  5e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.18 
 
 
625 aa  82.8  8e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.11 
 
 
651 aa  82.8  9e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0494755  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  30.17 
 
 
265 aa  82  1e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>