72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12121 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_12121  porin  100 
 
 		 383 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  53.92 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  54.26 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  48.99 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  49.03 
 
 		 399 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  42.3 
 
 		 449 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  45.99 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  40.98 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  35.58 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  31.19 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  33.18 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  31.28 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  33.73 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  30.86 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.89 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  34.49 
 
 		 431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  35.29 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  29.13 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29 
 
 		 510 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  29.65 
 
 		 514 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  27.93 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  27.63 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  29.26 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.23 
 
 		 500 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  26.54 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  31.73 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  27.86 
 
 		 528 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  28.5 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  26.48 
 
 		 543 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  27.82 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  31.33 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  32.49 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.88 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.9 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  27.81 
 
 		 515 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  25.91 
 
 		 555 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  26.2 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.87 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  22.57 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  29.48 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  25.29 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  25.29 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  25.12 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  27.08 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  27.17 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  26.9 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  23.19 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  25.39 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  24.63 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  24.51 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  25.49 
 
 		 531 aa  57  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  25.76 
 
 		 589 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  32.37 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  22.89 
 
 		 563 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  53.06 
 
 		 188 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  34.45 
 
 		 561 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  25.18 
 
 		 548 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  24.2 
 
 		 574 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  23.29 
 
 		 571 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  21.31 
 
 		 508 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  25.95 
 
 		 542 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  41.12 
 
 		 578 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  33.7 
 
 		 606 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  24.38 
 
 		 629 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  26.74 
 
 		 529 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  24.68 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  30.99 
 
 		 622 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  29.56 
 
 		 658 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  24.4 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  27.78 
 
 		 568 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  21.54 
 
 		 581 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>