More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17491 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  72.66 
 
 		 128 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  83.96 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  83.96 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  84.91 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  83.96 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  83.02 
 
 		 133 aa  189  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  71.65 
 
 		 125 aa  187  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  70.23 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  73.23 
 
 		 123 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  64.96 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  64.96 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  64.49 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  59.35 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  56.41 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  53.85 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  58.88 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  43.36 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  39.13 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 161 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 220 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  36.29 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 225 aa  88.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 242 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  36.97 
 
 		 177 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  39.66 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  35.65 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 222 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  40.57 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  41.35 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  34.11 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  38.46 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  34.62 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  36.13 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.04 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  29.71 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 236 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  28.76 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.59 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  31.17 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  33.05 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  31.17 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  36.28 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0611  single-stranded DNA-binding protein  33.77 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0751618  hitchhiker  0.00325806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  28.03 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>