More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4527 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  41.56 
 
 		 948 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  41.74 
 
 		 947 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  40.2 
 
 		 968 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  40.2 
 
 		 968 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  39.6 
 
 		 968 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  41.95 
 
 		 948 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  42.22 
 
 		 949 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  39.02 
 
 		 975 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  40.66 
 
 		 968 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  39.15 
 
 		 969 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  40.02 
 
 		 968 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  40.65 
 
 		 948 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  41.64 
 
 		 948 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  40.04 
 
 		 968 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 982 aa  1943    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  37.87 
 
 		 958 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  37.67 
 
 		 958 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  39.49 
 
 		 969 aa  695    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  40.36 
 
 		 968 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  40.2 
 
 		 968 aa  668    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  40.14 
 
 		 948 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  40.3 
 
 		 968 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  41.64 
 
 		 948 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  40.2 
 
 		 968 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  39.44 
 
 		 967 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  38.42 
 
 		 968 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  42.67 
 
 		 949 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  40.3 
 
 		 968 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  38.47 
 
 		 968 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  38.62 
 
 		 968 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  41.84 
 
 		 948 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  40.14 
 
 		 968 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  39.36 
 
 		 968 aa  680    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  39.38 
 
 		 967 aa  667    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  40.3 
 
 		 968 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  39.46 
 
 		 967 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  39.67 
 
 		 944 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  40.56 
 
 		 968 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  39.6 
 
 		 969 aa  682    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  40.12 
 
 		 968 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  39.39 
 
 		 969 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  42.05 
 
 		 948 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  38.58 
 
 		 943 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  40.96 
 
 		 968 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  41.18 
 
 		 968 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  39.5 
 
 		 968 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  39.42 
 
 		 967 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  40.2 
 
 		 968 aa  668    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  42.05 
 
 		 950 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  39.7 
 
 		 947 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  40.96 
 
 		 968 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  40.4 
 
 		 968 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  40.26 
 
 		 968 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  40.3 
 
 		 968 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  39.6 
 
 		 968 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  39.8 
 
 		 967 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  38.65 
 
 		 970 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  38.99 
 
 		 968 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  40.02 
 
 		 968 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  39.96 
 
 		 953 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  40.02 
 
 		 968 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  39.5 
 
 		 968 aa  657    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  39.45 
 
 		 919 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  36.98 
 
 		 1028 aa  596  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  37.21 
 
 		 982 aa  595  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  36.87 
 
 		 966 aa  579  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  38.29 
 
 		 980 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  37.75 
 
 		 960 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  34.15 
 
 		 942 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  32.66 
 
 		 874 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  30.52 
 
 		 892 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.2 
 
 		 898 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  33.86 
 
 		 898 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.98 
 
 		 962 aa  148  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.22 
 
 		 969 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 933 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 941 aa  138  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 941 aa  138  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  31.93 
 
 		 905 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.01 
 
 		 1170 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.31 
 
 		 988 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  26.51 
 
 		 560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.05 
 
 		 555 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.07 
 
 		 560 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.63 
 
 		 572 aa  129  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.51 
 
 		 560 aa  128  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 560 aa  126  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  44.56 
 
 		 1094 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  23.34 
 
 		 669 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  25.86 
 
 		 584 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  25.53 
 
 		 584 aa  121  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.21 
 
 		 927 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 1046 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.34 
 
 		 1095 aa  115  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  36.51 
 
 		 925 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.13 
 
 		 1170 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.53 
 
 		 954 aa  108  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  30.29 
 
 		 346 aa  108  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.96 
 
 		 1028 aa  107  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  33.64 
 
 		 922 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>