More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0112 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  42.68 
 
 		 968 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  41.68 
 
 		 968 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  41.68 
 
 		 968 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  41.6 
 
 		 968 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  43.96 
 
 		 948 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  40.61 
 
 		 944 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  40.53 
 
 		 968 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  40.69 
 
 		 949 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  41.12 
 
 		 968 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  42.52 
 
 		 967 aa  685    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  41.01 
 
 		 919 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  40.16 
 
 		 975 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  42.27 
 
 		 968 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  42.48 
 
 		 968 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  42.48 
 
 		 968 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  43.24 
 
 		 948 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  38.56 
 
 		 958 aa  666    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  38.56 
 
 		 958 aa  662    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  42.98 
 
 		 948 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  78.5 
 
 		 982 aa  1561    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  40.59 
 
 		 968 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  40.49 
 
 		 968 aa  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  44.12 
 
 		 948 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  43.6 
 
 		 948 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  41.12 
 
 		 968 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  40.59 
 
 		 968 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  41.12 
 
 		 968 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  40.78 
 
 		 968 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  41.54 
 
 		 969 aa  718    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  44.18 
 
 		 948 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  43.65 
 
 		 948 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  42.48 
 
 		 968 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  41.58 
 
 		 968 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  41.82 
 
 		 968 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  41.39 
 
 		 968 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  42.46 
 
 		 953 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 960 aa  1967    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  78.19 
 
 		 1028 aa  1554    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  41.51 
 
 		 967 aa  683    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  41.45 
 
 		 969 aa  707    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  40.71 
 
 		 943 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  41.44 
 
 		 966 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  42.78 
 
 		 968 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  42.78 
 
 		 968 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  41.61 
 
 		 969 aa  693    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  41.12 
 
 		 968 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  41.29 
 
 		 968 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  40.47 
 
 		 969 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  43.92 
 
 		 950 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  42.32 
 
 		 967 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  42.78 
 
 		 968 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  41.68 
 
 		 968 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  44.51 
 
 		 949 aa  727    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  41.7 
 
 		 967 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  41.94 
 
 		 968 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  40.77 
 
 		 947 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  42.68 
 
 		 968 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  41.58 
 
 		 968 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  41.66 
 
 		 968 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  39.96 
 
 		 968 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  41.86 
 
 		 967 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  43.85 
 
 		 948 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  41.92 
 
 		 970 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  41.68 
 
 		 968 aa  699    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  44.54 
 
 		 947 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  40.86 
 
 		 968 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  38.42 
 
 		 980 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  37.75 
 
 		 982 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  36.08 
 
 		 942 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  36 
 
 		 874 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  32.68 
 
 		 898 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  32.35 
 
 		 892 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  32.54 
 
 		 898 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  33.2 
 
 		 905 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.5 
 
 		 555 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  28.78 
 
 		 560 aa  140  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  26.58 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  27.46 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.46 
 
 		 554 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 560 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 933 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  25.44 
 
 		 1129 aa  132  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.69 
 
 		 988 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1046 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  35.68 
 
 		 941 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  35.68 
 
 		 941 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.87 
 
 		 972 aa  115  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.13 
 
 		 1065 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.13 
 
 		 1065 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.18 
 
 		 947 aa  112  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  37.56 
 
 		 578 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  35.65 
 
 		 962 aa  110  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  35.78 
 
 		 900 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>