More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1649 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  45.96 
 
 
877 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  62.8 
 
 
837 aa  1094    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  45.76 
 
 
851 aa  684    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  45.82 
 
 
843 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  47.9 
 
 
835 aa  728    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  57.91 
 
 
823 aa  955    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  60.59 
 
 
835 aa  997    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  100 
 
 
852 aa  1739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  43.63 
 
 
833 aa  619  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  42.28 
 
 
847 aa  598  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  41.11 
 
 
841 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  40.93 
 
 
826 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.3 
 
 
847 aa  446  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  33.33 
 
 
839 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  35.56 
 
 
862 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  37.07 
 
 
835 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  33.57 
 
 
848 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  30.94 
 
 
886 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  35.04 
 
 
838 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.53 
 
 
836 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  33.06 
 
 
872 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  31.94 
 
 
810 aa  362  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  29.63 
 
 
817 aa  351  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  31.5 
 
 
783 aa  340  5e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.28 
 
 
828 aa  336  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  28.52 
 
 
783 aa  334  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  28.48 
 
 
783 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  37.17 
 
 
835 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  34.43 
 
 
840 aa  327  8.000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.06 
 
 
783 aa  318  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  32.16 
 
 
825 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  33.21 
 
 
832 aa  294  5e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  38.81 
 
 
873 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  32.51 
 
 
767 aa  283  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  26.35 
 
 
826 aa  272  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  39.02 
 
 
805 aa  271  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  37.8 
 
 
839 aa  270  7e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  31.75 
 
 
723 aa  261  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  33.67 
 
 
822 aa  257  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  34.89 
 
 
818 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  35.15 
 
 
790 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  34.72 
 
 
792 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  35.77 
 
 
790 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  41.18 
 
 
792 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  34.19 
 
 
834 aa  248  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  41.18 
 
 
790 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  32.82 
 
 
649 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  27.4 
 
 
878 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  44.48 
 
 
413 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  34.69 
 
 
639 aa  240  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  32.07 
 
 
667 aa  239  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  33.22 
 
 
641 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  33.46 
 
 
637 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  33.05 
 
 
638 aa  235  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.23 
 
 
746 aa  235  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  34.78 
 
 
629 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  29.95 
 
 
622 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  34.24 
 
 
638 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  25.79 
 
 
716 aa  233  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  36.17 
 
 
654 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  35.56 
 
 
654 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  35.98 
 
 
654 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  35.98 
 
 
654 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  35.98 
 
 
654 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  34.91 
 
 
790 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  34.37 
 
 
638 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  31.87 
 
 
644 aa  232  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  34.31 
 
 
638 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  34.19 
 
 
638 aa  231  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  33.79 
 
 
638 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  34.66 
 
 
666 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  34.66 
 
 
666 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  33.16 
 
 
638 aa  229  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  33.62 
 
 
638 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  40.19 
 
 
407 aa  228  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  39.89 
 
 
696 aa  228  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  33.79 
 
 
638 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  33.62 
 
 
638 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2431  peptidase U32  34.54 
 
 
657 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  35.15 
 
 
667 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  35.81 
 
 
655 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  34.91 
 
 
653 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  38.24 
 
 
420 aa  226  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  34.91 
 
 
653 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  34.91 
 
 
653 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  34.91 
 
 
667 aa  225  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  36.98 
 
 
413 aa  224  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  36.58 
 
 
420 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  34.91 
 
 
667 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  34.91 
 
 
667 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  34.91 
 
 
667 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  38.54 
 
 
411 aa  224  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  33.7 
 
 
635 aa  224  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  39.42 
 
 
406 aa  223  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  43.81 
 
 
403 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  34.84 
 
 
640 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  34.5 
 
 
653 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  34.1 
 
 
666 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  34.64 
 
 
666 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.49 
 
 
404 aa  222  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>