241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0308 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
229 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  61.23 
 
 
242 aa  275  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  64.35 
 
 
242 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  57.92 
 
 
209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  57.92 
 
 
209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  61.88 
 
 
238 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  59.11 
 
 
239 aa  221  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  53.36 
 
 
264 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  48.44 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  53.52 
 
 
225 aa  204  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  42.03 
 
 
258 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  43.2 
 
 
623 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  44.44 
 
 
206 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  48.75 
 
 
199 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  52.27 
 
 
238 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  43.68 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  50.34 
 
 
325 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  44.94 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  44.19 
 
 
304 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  44.13 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  38.84 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  48.95 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  39.25 
 
 
213 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  37.43 
 
 
207 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  36.87 
 
 
213 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  42.38 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  45.89 
 
 
149 aa  114  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  36.96 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  39.52 
 
 
227 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  33.71 
 
 
198 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  40.32 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  37.63 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  40.32 
 
 
232 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  32.19 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.19 
 
 
236 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  32.19 
 
 
236 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.67 
 
 
746 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  32.29 
 
 
236 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  32.29 
 
 
236 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  32.29 
 
 
236 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.84 
 
 
236 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  32.29 
 
 
236 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  33.95 
 
 
200 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  33.97 
 
 
220 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  40.65 
 
 
225 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.7 
 
 
713 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.53 
 
 
705 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  34.25 
 
 
192 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  46.88 
 
 
722 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  39.34 
 
 
232 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  49.32 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  39.79 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  36.26 
 
 
185 aa  97.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  44.75 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  34.97 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  35.67 
 
 
267 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.91 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.22 
 
 
722 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  38.71 
 
 
223 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  37.36 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  37.24 
 
 
713 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.14 
 
 
722 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.61 
 
 
717 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  41.67 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 
716 aa  92  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  34.53 
 
 
239 aa  92  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  41.67 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  36.57 
 
 
704 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  34.24 
 
 
738 aa  88.6  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  38.41 
 
 
716 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  32.14 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  42.42 
 
 
717 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  38.78 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  38.78 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  38.78 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  34.9 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  36.36 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  36.81 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.65 
 
 
717 aa  85.5  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  33.52 
 
 
233 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  32.91 
 
 
714 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.31 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  41.18 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  38.28 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.88 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.52 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  39.85 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  40.28 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  40.14 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  37.16 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.24 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>